Με απόφασή της, του Σεπτεμβρίου 2019, η Ανεξάρτητη Αρχή Δημοσίων Εσόδων (ΑΑΔΕ), δέχεται την απόφαση 355/2019 του Συμβουλίου της Επικρατείας και προχωρά στην μείωση του ΦΠΑ της προσφεύγουσας επιχείρησης, κατά το ποσό του ΦΠΑ που κατέστη ανεπίδεκτο εισπράξεως.
Συγκεκριμένα με απόφαση του προϊσταμένου της Διεύθυνσης Επίλυσης Διαφορών γίνεται δεκτή η προσφυγή της εταιρίας και μειώνεται το ποσό του ΦΠΑ που καλείται να καταβάλει. Και η απόφαση αυτή δημιουργεί ισχυρό προηγούμενο για την χρεωκοπία της Thomas Cook και τις επιπτώσεις στις ελληνικές τουριστικές ειχειρήσεις και τα ξενοδοχεία.